柯南最近的日子過得很豐富多彩，因為他最終還是被迫回到了小學一年級，而且還被三個小鬼頭盯上。
在經曆了一場“鬼屋”探險後，找出了五年前一起凶案的真相。
然後又跟著靠“沉睡的小五郎”名聲大噪賺了不少錢的毛利父女外出旅行，在回程的豪華遊輪上處理了一起豪門恩怨。
回家後沒多久又處理了一起醫鬨。
反正紀一也不知道是不是因為柯南最近業務比較繁忙，所以有希子和優作暫時還沒有下手。
好消息是或許是因為柯南最近的業績多數在外地或是事後才報警，整個警視廳搜查一課很長一段時間的工作量都減輕了不少。
此時的毛利偵探事務所內，柯南正在玩遊戲。
而小蘭則在旁邊詢問關於柯南爸媽的事情。
柯南回頭撇了一眼，手上動作不停，隻是“哦”了一聲就回頭繼續全神貫注於戰鬥。
“哦什麼哦！你的父母調職去了海外後，就把你一個人丟在這裡，實在太不像話了！你真是太可憐了！”
小蘭生氣了，聲音大了起來。
而毛利小五郎也開始念叨過了這麼久，柯南的父母一點消息沒有。
父女兩人正商量著去找阿笠博士問問怎麼聯係柯南父母。
正在柯南迅速思考如何解決現在的困境時，有人按了門鈴。
小蘭去開門，和來人簡單溝通了兩句後，滿臉開心地回過頭對柯南說：“柯南，有人來接你了，你看看門口，你媽媽來接你了！”
柯南看過去，是一個圓臉有點胖胖的女人。
“哈？”柯南懵逼。
“小南，真對不起，讓你一個人孤零零地留在這裡，一定很寂寞吧……”
說著，女人跪下來，一把抱住柯南，直接把柯南嚇出了表情包。
緊接著，柯南從女人懷裡掙脫，拚命大喊不認識對方。
可女人隻是露出苦惱的表情解釋說這是小孩子在耍性子，然後又把名片遞給毛利父女，自稱江戶川文代。
看著交談甚歡的毛利父女和“江戶川文代”，柯南已經嚇傻了。
柯南隻是編造的人物，怎麼可能會有母親？
毛利父女沒有一點疑心地將柯南交給了江戶川文代，並完全無視了坐在副駕駛座上，將車窗錘得哐哐作響的柯南。
“這位太太，可彆忘了你的謝禮喔！”
對著離開的車，小五郎不忘叮囑一聲。
“再見了，柯南……”小蘭在心裡默默念著。
在車上，江戶川文代清晰地點出了柯南的真實身份工藤新一，直接把柯南嚇傻了。
不過他也趁女人掏槍威脅的機會，一腳踩到油門讓車輛失控撞進停車場並趁機逃走。
此時的柯學世界已經進入了冬天，在漫天飛雪中，柯南艱難地逃生。
一路上他都在想為什麼自己會暴露，明明自己變小後完全沒有暴露身份。（注1）
現在也不能返回毛利偵探事務所，因為那會讓小蘭陷入危險。
最終他決定去向阿笠博士求助。
可博士不在家，他在頂著漫天大雪在牆角等了許久才看到回來的博士，正準備上前，卻被人從背後迷暈了。
再醒過來，就被人用繩子捆在房間裡，又聽到了一大段足以在琴酒s大賽中擊敗琴酒的對話，不過柯南也從中提取了關鍵信息，比如明天的交易之類的。
等到夜深，他用撞碎的酒瓶割斷繩子，並幸運地找到了房間內墊子下的儲物室躲了進去，成功在第二天騙過了兩人。
等兩人出發去進行交易後，他才終於敢出來，在屋子裡搜集線索。
最終從剪得坑坑窪窪的報紙和掛曆上確定了“米花豪華飯店30”。
一路追蹤過去，又推理出30是車位，並終於成功跟蹤形跡可疑的高大男人找到了301房間。
又在差點被發現前混進了隔壁房間，為了騙小孩說出了無比黑曆史的“我是宇宙偵探柯南”，以及利用蝴蝶結變聲器偽裝成“萊波星人”。
還用“宇宙偵探柯南的最高機密”這種羞恥度拉滿的理由騙走隔壁小女生的口香糖。
在完成這一切後，柯南又借用服務員送餐的機會，利用口香糖黏住鑰匙孔混進了301房間。
就當他混進衣櫃躲起來，剛鬆了口氣時。
就聽到外麵的帶著詭異笑臉麵具的高禮帽男人開口：“我先向你們介紹一位客人。”
柯南嚇尿了。
女人立刻去翻餐車，沒有收獲。
而那個男人卻一把拉開了門口衣櫃。
“事實上，他躲在這個衣櫃中！”
槍指頭，柯南這次是真的嚇傻了，想用手表麻醉針，卻發現已經被人弄壞了。
“再見了，高中生偵探工藤新一！”
男人扣動了扳機。
一瞬間，柯南想到了很多。
然而，那是玩具槍。
屋子裡的人都笑了起來。
柯南一臉懵逼地看著麵前的男人摘下麵具。
這真是他爹。
不出所料，那個自稱他媽媽的人，也真是他媽，至於所謂的交易對象，則是阿笠博士。
柯南無語。
優作也開始解釋這是對柯南的推理測試，並評論水平勉強及格。
最後，優作和有希子笑眯眯地提議：“你還是快點離開這個危險的國家，和爸媽一起到國外過悠閒日子吧！”
至於恢複身體的藥，優作也表示他已經拜托在國際刑警工作的朋友去調查酒廠。
“所以，停止你的偵探遊戲吧！”
“不！我自己的事情自己解決！你們彆插手！”
柯南直截了當地拒絕，“而且……我還有……無法離開日本的理由！”
背後傳來一陣笑聲。
柯南回過頭，看到東野紀一正舉著攝像機站在後麵。
“東野警部？”柯南懵了，自己爸媽和阿笠博士就算了，怎麼還有這個人的事情？
然後他就看到一個小女孩從大門口鑽了進來。
女孩摘下帽子，露出一頭微卷的茶發。
“啊拉，原來可以模仿各種聲音的萊波星宇宙偵探柯南的最高機密就是用口香糖來打開門鎖嗎？”女孩的語氣很平淡，但是在柯南耳裡卻顯得無比陰陽怪氣。
“你又是誰啊……”柯南露出死魚眼，這群大人胡鬨就算了，你一個小女孩在這裡搞什麼？
“atx4869，就是你被灌下的那種藥物，是組織命令我做的。”