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小剛加入了小智一行人，在離開了尼比市後，眼前就是月見山了。月見山有一則傳言說，這座山上有月亮石。月亮石是可以讓皮皮進化成皮卡西的進化石道具。
“皮卡。”皮卡丘豎起了耳朵，小智他們也聽到了不遠處傳來的呼救聲，於是他們就決定去看看。
一個身穿白大褂的青年正在被一群超音輻攻擊。
小智道：“皮卡丘去救那個人，使用電擊。”
“皮卡~丘！”皮卡丘從小智的肩膀跳了起來，電擊發出，挑戰多隻超音輻也不在話下，電擊結束，超音輻們紛紛爭先恐後的回到了不遠處的洞窟裡。
“麻！好麻啊！”
小智接住了皮卡丘，突然就被剛才救下的青年抱住：“太偉大了，我太感動了！謝謝你們的幫忙！”
“皮卡~丘！”皮卡丘再次一發電擊，它剛才被小智抱在懷中，被嚇到又被青年擠到所以才一發電擊伺候。
小智趕緊安撫道：“皮卡丘沒事了！”皮卡丘朝被再次電到的青年哼了一聲，繼續趴在了小智的肩膀上。
青年站了起來，扶了扶眼睛：“不好意思，嚇到你了！我隻是太感動了，謝謝你們為我展現出了人類與寶可夢的溫馨友情。”
小霞疑惑道：“友情？小智與皮卡丘的感情確實是挺好。”
青年道：“對啊，就算沒有精靈球，人類與寶可夢還是能夠互相了解的。遇見你們，我不禁被推上了感動與興奮的最高潮。”
小霞戳了戳了小智，與小剛一起三人湊到一起，小霞道：“這人總感覺怪怪的。”
小剛道：“我有同感。”
青年感動完了，又來握住小智的手：“謝謝你讓我感動！”
小智滿頭的黑線：“不......客氣。但超音輻為什麼要攻擊你呢？”
青年道：“我是尼比市科學博物館的愛於勇氣的研究員，李科。”
小霞小聲道：“果然很奇怪。”
李科指著剛才超音輻逃離的洞穴道：“你們跟我來看看就知道了。”
小智他們跟著李科進入到洞穴裡，比起外麵，裡麵還要更亮一些，每走幾步就有一個明亮異常的燈。
李科道：“你們看看這裡，是不是跟白天一樣，一些奇怪的人把洞窟搞成這樣，害得寶可夢們的生活就失去了平衡。”
小剛補充道：“意思是不是，超音輻們就是被這強烈的光線害的失常了嗎？”
李科點了點了頭："沒錯，你們看派拉斯居然將背上的蘑菇拿來種植，那邊的穿山鼠乾燥的快要脫水，一點力氣都沒有。我為了保護月見山不受破壞，才到處巡邏的。"
小霞問道：“那為什麼月見山會受到破壞呢？”
小剛替李科給小霞解釋道：“應該是為了月亮石吧！”
李科歎了口氣道：“是的，月亮石擁有可以讓寶可夢進化的能力的相關報告問世開始，就有很多人就跑來月見山挖掘，慢慢的就搞成了現在的這副樣子了！”
一隻懷抱著月亮石的皮皮從小智他們身邊掠過。
小剛用力揉了揉眼睛：“剛才那隻是皮皮吧！”
小霞看了過去：“好可愛啊！”
小智道：“你們看皮皮好像要去什麼地方一樣，我們跟去看看吧！”
“哈哈哈，被我發現了喵！”
小霞道：“這個聲音是？”
小智無奈：“應該就是那些人了，我還說才消停了幾天，原來他們也到月見山了。”
小智他們追了過去，就看見了火箭隊三人。
武藏道：“小鬼頭？”
小智道：“怎麼又是你們三個？”
“既然你......”
小智打斷道：“來點新意的不行嗎？”
武藏怒道：“小鬼頭彆打斷我們！”
小智拿出了精靈球：“巴大蝶就決定是你了！”
小剛道：“小智我來幫你，你也去吧！”小剛幾乎與小智同時扔出了精靈球。
“阿柏蛇去吧/瓦斯彈你也去。”
小智道：“小剛你什麼時候收服的超音輻啊？”小智看見小剛從精靈球裡召喚出來的是超音輻，他沒有注意到小剛是什麼時候收服的超音輻啊？
小剛道：“剛在洞口的時候。”
“瓦斯彈用毒瓦斯。”
瓦斯彈的毒瓦斯充斥在這個並不算寬敞的山洞裡麵。
小智與小剛對視一眼。
“巴大蝶起風！將毒瓦斯吹散。”
“超音輻你也幫忙！”
巴大蝶與超音輻一同扇動翅膀，將毒瓦斯吹散。
“阿柏蛇咬住。”
阿柏蛇張開嘴用尖銳的牙撲向巴大蝶。
“瓦斯彈撞擊。”
瓦斯彈則是用整個身體撞向超音輻。
“巴大蝶幻象光線。”
巴大蝶的身前凝聚出了一個光球，從中發射出光線攻擊向阿柏蛇。
“超音輻超音波。”
從超音輻的嘴裡發射出一圈圈的超音波。
在阿柏蛇和瓦斯彈近身前就讓兩隻同時陷入了混亂。阿柏蛇和瓦斯彈扭打在了一起。
小智微微一笑：“巴大蝶吹飛，送他們走！”
巴大蝶的翅膀扇出了強烈的風，火箭隊一起被送走了！
“皮皮！”皮皮上前表示感謝，並指著一個方向。
小智道：“解決了火箭隊之後，心情都暢快了許多，我們跟皮皮去看看吧！”
眾人紛紛點頭。
皮皮帶著眾人，穿梭在交錯縱橫的通道裡，眾人眼前忽然一亮。皮皮先從山壁上的洞鑽了出去，小智他們緊跟其後。離開通道後竟是一片草地。
小霞道：“已經到外麵了？”
小智將李科從洞中拉出來：“看樣子是的。”
小剛抬頭看著天空：“我們都沒有注意到，天要黑了！”
一行人跟著皮皮又走了快半個小時，直到天完全黑了之後，才找到一個草叢掩映的山洞。穿過山洞就是一個露天的巨大坑洞樣式的山洞。
李科道：“你們看，這應該就是月亮石的本尊吧！”
此時月光照射在正中心放著的巨大月亮石上，閃耀著點點星光，很是漂亮。
小剛道：“感覺有種不可思議的感覺。”
“皮皮。”皮皮將抱著的那顆月亮石放在了巨大月亮石的旁邊。
月亮石開始泛出淡藍色的光芒。
小霞驚呼道：“好多皮皮啊！”
許多的皮皮從暗處走了出來，紛紛朝著小智他們低下了頭。看得出來是在跟他們道謝。
道謝完後，皮皮們就圍著月亮石開始跳起了舞。皮皮們跳著跳著，就進化成了皮可西。
小霞道：“皮皮是這樣進化的嗎？”
小智道：“皮可西應該是不想被人破壞它們的生活吧！要不然也就不會帶我們過來見證這個時候了！”
小剛道：“那我們也不要辜負皮可西它們的好意，就在旁邊靜靜的看著吧！”
李科堅定道：“我決定了，我要留下來保護皮可西它們，和它們一起生活。”
小智三人相視一眼，都滿是笑意。
第二天，小智三人就告彆了李科和皮可西們離開了月見山。